Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB85

Rrp8, Ribosomal RNA-processing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp8Q9DB85 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rrp8Q9DB85 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp8Q9DB85 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms