Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fundc1Q9DB70 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms