Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD9

H2al1m, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1mQ9DAD9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.96
H2al1mQ9DAD9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
H2al1mQ9DAD9 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
H2al1mQ9DAD9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
H2al1mQ9DAD9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
H2al1mQ9DAD9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
H2al1mQ9DAD9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
H2al1mQ9DAD9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
H2al1mQ9DAD9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
H2al1mQ9DAD9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
H2al1mQ9DAD9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
H2al1mQ9DAD9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms