Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sgf29Q9DA08 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms