Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D9D9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D9D9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D9D9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms