Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TcimQ9D915 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms