Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx5Q9D8U8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx5Q9D8U8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms