Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifrd2Q9D8U0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifrd2Q9D8U0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms