Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rexo2Q9D8S4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rexo2Q9D8S4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms