Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmem54Q9D7S1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem54Q9D7S1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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