Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tmigd1Q9D7L8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Tmigd1Q9D7L8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Tmigd1Q9D7L8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Tmigd1Q9D7L8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmigd1Q9D7L8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Tmigd1Q9D7L8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Tmigd1Q9D7L8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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