Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Echdc3Q9D7J9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Echdc3Q9D7J9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Echdc3Q9D7J9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Echdc3Q9D7J9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Echdc3Q9D7J9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Echdc3Q9D7J9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Echdc3Q9D7J9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Echdc3Q9D7J9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Echdc3Q9D7J9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Echdc3Q9D7J9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Echdc3Q9D7J9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms