Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn23Q9D7D7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn23Q9D7D7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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