Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl40Q9D783 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl40Q9D783 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms