Protein–RNA interactions for Protein: Q9D746

2310034C09Rik, RIKEN cDNA 2310034C09, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310034C09RikQ9D746 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
2310034C09RikQ9D746 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms