Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbe1Q9D6Y9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms