Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necab3Q9D6J4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necab3Q9D6J4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms