Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc94Q9D6J3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms