Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc39Q9D5Y1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms