Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PudpQ9D5U5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms