Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a3Q9D554 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a3Q9D554 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms