Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syce1Q9D495 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syce1Q9D495 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms