Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efhc2Q9D485 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms