Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd2Q9D3B1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms