Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox1Q9D350 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox1Q9D350 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms