Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rasgef1cQ9D300 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rasgef1cQ9D300 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rasgef1cQ9D300 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1cQ9D300 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms