Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx20Q9D2Y5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Snx20Q9D2Y5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx20Q9D2Y5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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