Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D1F3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D1F3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms