Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C9

Rrp7a, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp7aQ9D1C9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrp7aQ9D1C9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrp7aQ9D1C9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrp7aQ9D1C9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp7aQ9D1C9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp7aQ9D1C9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp7aQ9D1C9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp7aQ9D1C9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp7aQ9D1C9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp7aQ9D1C9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp7aQ9D1C9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp7aQ9D1C9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp7aQ9D1C9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp7aQ9D1C9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp7aQ9D1C9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp7aQ9D1C9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp7aQ9D1C9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp7aQ9D1C9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrp7aQ9D1C9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp7aQ9D1C9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms