Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem53Q9D0Z3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms