Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pbdc1Q9D0B6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pbdc1Q9D0B6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms