Protein–RNA interactions for Protein: Q9D030

Twist2, Twist-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist2Q9D030 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Twist2Q9D030 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Twist2Q9D030 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms