Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid3bQ9CYY7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms