Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rrs1Q9CYH6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rrs1Q9CYH6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms