Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd4Q9CWX4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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