Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Malsu1Q9CWV0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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