Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pfdn1Q9CWM4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pfdn1Q9CWM4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn1Q9CWM4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Pfdn1Q9CWM4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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