Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ctnnbl1Q9CWL8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms