Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms