Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snw1Q9CSN1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms