Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Chchd5Q9CQP3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Chchd5Q9CQP3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd5Q9CQP3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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