Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms