Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rwdd1Q9CQK7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rwdd1Q9CQK7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms