Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdm1Q9CQK3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdm1Q9CQK3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdm1Q9CQK3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdm1Q9CQK3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdm1Q9CQK3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdm1Q9CQK3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdm1Q9CQK3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdm1Q9CQK3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdm1Q9CQK3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdm1Q9CQK3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdm1Q9CQK3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdm1Q9CQK3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdm1Q9CQK3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdm1Q9CQK3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdm1Q9CQK3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdm1Q9CQK3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Rdm1Q9CQK3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Rdm1Q9CQK3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rdm1Q9CQK3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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