Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sar1bQ9CQC9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sar1bQ9CQC9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms