Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc5Q9CQA1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms