Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms