Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ3

Uncharacterized protein C1orf185 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPZ3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CPZ3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms