Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn6Q99PL6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms