Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim8Q99PJ2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim8Q99PJ2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms